Đường bộ
Các tuyến xe buýt đi qua địa bàn huyện gồm có các tuyến: 07, 15, 17, 25, 35B, 43, 46, 53A, 53B, 56A, 58, 59, 60B, 61, 63, 64, 65, 86, 90, 93, 95, 96, 109, 112, 212, CNG03, CNG04
- 07: Cầu Giấy - Sân bay Nội Bài đi qua cao tốc Thăng Long - Nội Bài
- 15: Bến xe Gia Lâm - Phố Nỉ (TTTM Bình An) đi qua quốc lộ 3
- 17: Long Biên - Sân bay Nội Bài đi qua quốc lộ 3
- 25: BV Bệnh nhiệt đới TW CS2 - Bến xe Giáp Bát đi qua đường 5 kéo dài, đường Võ Nguyên Giáp, KCN Bắc Thăng Long
- 35B: Trần Khánh Dư - Mê Linh đi qua cao tốc Nhật Tân - Nội Bài (ngã tư Nam Hồng đi Mê Linh)
- 43: CV Thống Nhất - TT Đông Anh đi qua quốc lộ 3, Cao Lỗ
- 46: Bến xe Mỹ Đình - Cổ Loa - TT Đông Anh đi qua cầu Thăng Long, đường 6 cây, đường quốc lộ 3, đường Cổ Loa
- 53A: Hoàng Quốc Việt - TT Đông Anh đi qua cầu Thăng Long, đường 6 cây, đường Vân Trì, cầu vượt Vân Trì, đường 23B, Cao Lỗ
- 53B: Bến xe Mỹ Đình - Chi Đông đi qua KCN Bắc Thăng Long, cao tốc Thăng Long - Nội Bài
- 56A: Nam Thăng Long - Núi Đôi đi qua cao tốc Thăng Long - Nội Bài
- 58: Yên Phụ - BV đa khoa Mê Linh đi qua cao tốc Thăng Long - Nội Bài
- 59: TT Đông Anh - Đại học Nông nghiệp Hà Nội đi qua đường Cao Lỗ, quốc lộ 3
- 60B: Bến xe Nước Ngầm - BV Bệnh nhiệt đới TW CS2 đi qua cao tốc Thăng Long - Nội Bài, KCN Bắc Thăng Long
- 61: Vân Hà (Đông Anh) - Công viên Cầu Giấy đi qua đường Vân Hà, Liên Hà, Việt Hùng, Cao Lỗ, đường Vân Trì, đường 6 cây, cầu Thăng Long, Phạm Văn Đồng, Nam Thăng Long
- 63: KCN Bắc Thăng Long - Tiến Thịnh (Mê Linh) đi qua KCN Bắc Thăng Long, cao tốc Thăng Long - Nội Bài (ngã tư Nam Hồng)
- 64: KCN Bắc Thăng Long - Phố Nỉ (TTTM Bình An) đi qua KCN Bắc Thăng Long, cao tốc Thăng Long - Nội Bài
- 65: Thuỵ Lâm (Đông Anh) - Long Biên đi qua đường Thuỵ Lâm, Tập thể Z153, Ấp Tó, Đản Dị, Chợ Tó, Việt Hùng, Dục Tú, Quốc lộ 3, Đông Hội, cầu Đông Trù, Nguyễn Văn Cừ, cầu Chương Dương, Long Biên
- 86: Ga Hà Nội - Sân bay Nội Bài đi qua đường Võ Nguyên Giáp, cầu Nhật Tân
- 90: Kim Mã - Sân bay Nội Bài đi qua đường Võ Nguyên Giáp, cầu Nhật Tân
- 93: Nam Thăng Long - Bắc Sơn đi qua cao tốc Thăng Long - Nội Bài
- 95: Nam Thăng Long - Xuân Hòa đi qua cao tốc Thăng Long - Nội Bài
- 96: Công viên Nghĩa Đô - Đông Anh: Công viên Nghĩa Đô - Nguyễn Văn Huyên - Hoàng Quốc Việt - Bưởi - Võ Chí Công - Võ Nguyên Giáp - Cầu Nhật Tân - Quốc lộ 5 (kéo dài) - Vân Trì - Quốc lộ 23B - Nam Hồng - Bắc Hồng - Nguyên Khê - Đông Anh (Trường Cao đẳng nghề Việt Nam Hàn Quốc)
- 109: Bến xe Mỹ Đình - Sân bay Nội Bài đi qua cao tốc Thăng Long - Nội Bài
- 112: KCN Bắc Thăng Long - Thạch Đà (Mê Linh) đi qua KCN Bắc Thăng Long, đường Đại Mạch, đê Tả Hồng
- 212: Hà Nội – Bắc Ninh đi qua, KCN Bắc Thăng Long, đường Võ Văn Kiệt
- CNG03: BV Bệnh nhiệt đới TW CS 2 - Times City đi qua KCN Bắc Thăng Long, đường Võ Văn Kiệt, đường Hoàng Sa, đường Võ Nguyên Giáp
- CNG04: Kim Lũ - Nam Thang Long đi qua quốc lộ 3, quốc lộ 23, đường Hoàng Sa, đường 6 km, đường Võ Văn Kiệt
Các tuyến phố trên địa bàn huyện:
Các tuyến đường lớn đi qua địa bàn huyện:
- Đường 23B
- Quốc lộ 3
- Quốc lộ 3 mới (đường cao tốc Hà Nội - Thái Nguyên)
- Quốc lộ 23A (đường 6 cây (km))
- Đường cao tốc Thăng Long-Nội Bài (đường Võ Văn Kiệt)
- Đường cao tốc Nhật Tân-Nội Bài (đường Võ Nguyên Giáp)
- Quốc lộ 5 kéo dài gồm đường Trường Sa và đường Hoàng Sa
- Các cây cầu trên địa bàn huyện và nối huyện với các địa phương xung quanh: cầu Thăng Long, cầu Nhật Tân, cầu Đông Trù, cầu Phù Lỗ, cầu Lò So, cầu Lớn,cầu Ngũ Huyện Khê,cầu Đôi,cầu Cô Loa, cầu Đài Bi, cầu E, cầu Phương Trạch, cầu Lộc Hà, cầu sông Thiếp, cầu Vân Trì.
- Các cầu vượt cạn: cầu vượt Kim Chung, cầu vượt Nam Hồng, cầu vượt Vân Trì, cầu vượt Vĩnh Ngọc, cầu vượt Nguyên Khê, cầu vượt Vân Liên Hà
- Ngoài ra còn có dự án cầu Thượng Cát thuộc đường vành đai 3.5 Hà nội và cầu Tứ Liên bắc qua sông Hồng. cầu Thượng Thuy và cầu Mai Lâm qua sông Đuống.
Đường sắt
- Đường sắt Hà Nội - Lào Cai chạy qua các xã Dục Tú, Cổ Loa, Việt Hùng, Uy Nỗ, TT.Đông Anh, Tiên Dương, Bắc Hồng.
- Đường sắt Hà Nội - Thái Nguyên chạy qua TT.Đông Anh, xã Nguyên Khê.
- Đường sắt vận chuyển hàng hoá Bắc Hồng - Văn Điển chạy qua các xã Hải Bối, Kim Nỗ, Nam Hồng, Bắc Hồng.
- Các ga Cổ Loa, ga Đông Anh, ga Bắc Hồng.
- Các dự án đường sắt đô thị đi qua địa bàn huyện (dự kiến) là các tuyến số 2 (Nội Bài - Thượng Đình), tuyến số 4 (Liên Hà - Bắc Thăng Long), tuyến số 6 (Nội Bài - Ngọc Hồi), tuyến số 7 (Mê Linh - Ngọc Hồi).